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    AlleleID 物種識別和分類鑒別的綜合軟件

    細(xì)菌鑒定的實驗設(shè)計
    AlleleID是一款旨在解決細(xì)菌鑒定、病原體檢測或物種鑒定的綜合性桌面工具。以CulsSTW多序列比對為核心，AlleleID可以設(shè)計用于物種識別/交叉物種鑒定的基因芯片探針以及用于實時PCR的SYBR Green, TaqMan MGB, TaqMan探針, Molecular Beacons以及實時PCR引物。AlleleID還提供了支持可變剪切片段檢測的微陣列實驗設(shè)計。

    物種鑒定分析/跨物種實驗/等位基因鑒定分析
    AlleleID使用ClustalW對序列進(jìn)行排列，并分析保存和物種特定區(qū)域。您可以使用程序進(jìn)行實時PCR引物設(shè)計（包含SYBR Green引物設(shè)計）和雙標(biāo)簽探針設(shè)計（TaqMan probes,
    TaqMan MGB and molecular beacons）。這些檢測方法只用于進(jìn)行菌株檢測或從混合菌株中找到感興趣的物種。為了進(jìn)行交叉物種試驗，AlleleID通過識別保守區(qū)域來設(shè)計通用探針。對于相關(guān)的生物體，當(dāng)研究物種的基因組草圖不可用時，可以使用AlleleID來研究其基因表達(dá)。這些強(qiáng)大的功能可以幫助解決了很多具有挑戰(zhàn)性的難題，例如的檢測、鑒定、定量以及污染物、環(huán)境等的監(jiān)測。


    廣泛支持實時或定量PCR檢測和SNP/表達(dá)微陣列
    AlleleID可以設(shè)計最優(yōu)的SYBR Green引物、TaqMan探針、TaqMan Minor Groove Bingding
    (MGB)探針、FRET探針或者分子信標(biāo)，用于實時定量PCR差異基因表達(dá)SNP基因型分類試驗。您也可以設(shè)計實時PCR引物和雙標(biāo)記探針多達(dá)一萬個序列在一個單一的運(yùn)行SNP檢測或表達(dá)微陣列。

    AlleleID?
    Design qPCR and Microarray Assays for Related Organisms
    AlleleID? is a comprehensive desktop tool designed to address the challenges of bacterial identification, pathogen detection or species identification. With ClustalW multiple sequence alignment at its core, AlleleID? can be used to design species identification/cross species probes for microarrays or real time PCR including SYBR? Green, TaqMan? MGB, TaqMan? probes, Molecular Beacons and real time PCR primers. AlleleID? also offers support for designing microarray experiments for detecting alternative splicing events.

    Cross Species/Taxa Specific Assays

    Species Identification Assays

    Gene Splicing/Alternative Splicing using Microarrays

    Exon Junction Primer Design

    Real Time PCR Primer Design

    TaqMan? Probe Design

    SYBR? Green Primer Design

    Molecular Beacon Design

    FRET Probe Design

    Microarray Probe Design

    NEAT Assay Design

    Database Support

    Input & Output Formats
    多路連接依賴探針擴(kuò)增（MLPA）檢測拷貝數(shù)和突變檢測
    AlleleID是唯一設(shè)計MLPA合成探針或者由MRC Holland引入的多重連接依賴探針擴(kuò)增技術(shù)的程序，當(dāng)合適的工具包不可用時，研究人員能夠擴(kuò)展這項技術(shù)。這是一種快速增長的高通量基因圖譜分析方法?？梢詸z測外顯子缺失、拷貝數(shù)變化和CpG甲基化模式。具有成本效益合適、敏感性高、特異性好和可再生性好等特點(diǎn)。
    AlleleID教程
    設(shè)計Luminex xMAP試驗
    基于Luminex’s xMAP技術(shù)，AlleleID可以設(shè)計應(yīng)用于懸浮陣列系統(tǒng)的應(yīng)變-微分多重分析設(shè)計。如果您研究的是密切相關(guān)的生物體，這個功能可以幫助您在一個反應(yīng)體系中進(jìn)行等位基因特異性引物延伸（ASPE）和DHA檢測。


    多路連接依賴探針擴(kuò)增（MLPA）檢測拷貝數(shù)和突變檢測
    AlleleID是唯一設(shè)計MLPA合成探針或者由MRC Holland引入的多重連接依賴探針擴(kuò)增技術(shù)的程序，當(dāng)合適的工具包不可用時，研究人員能夠擴(kuò)展這項技術(shù)。這是一種快速增長的高通量基因圖譜分析方法?？梢詸z測外顯子缺失、拷貝數(shù)變化和CpG甲基化模式。具有成本效益合適、敏感性高、特異性好和可再生性好等特點(diǎn)。
    AlleleID為PamGene檢測設(shè)計了mRNA特異性,DNA特異性和突變特異性MLPA探針。這將使PamChip用戶在使用PamGene高精度檢測平臺時設(shè)計自己感興趣的基因探針檢測。結(jié)合這兩種技術(shù)，拷貝數(shù)的變化和突變可以很容易地在6小時內(nèi)檢測到。


    功能特征
    ? 物種鑒定試驗
    ? 基因芯片的基因拼接/選擇性剪接
    ? 外顯子連接引物設(shè)計
    ? 實時PCR引物設(shè)計
    ? TaqMan探針設(shè)計
    ? SyBR綠色底漆設(shè)計
    ? 分子信標(biāo)設(shè)計
    ? FRET探針設(shè)計
    ? 微陣列探針設(shè)計
    ? 精密化驗設(shè)計
    ? 數(shù)據(jù)庫支持
    ? 輸入輸出格式
    細(xì)菌鑒定的實驗設(shè)計
    AlleleID是一款旨在解決細(xì)菌鑒定、病原體檢測或物種鑒定的綜合性桌面工具。以CulsSTW多序列比對為核心，AlleleID可以設(shè)計用于物種識別/交叉物種鑒定的基因芯片探針以及用于實時PCR的SYBR Green, TaqMan MGB, TaqMan探針, Molecular Beacons以及實時PCR引物。AlleleID還提供了支持可變剪切片段檢測的微陣列實驗設(shè)計。
    AlleleID是一款旨在解決細(xì)菌鑒定、病原體檢測或物種鑒定的綜合性桌面工具。以CulsSTW多序列比對為核心，AlleleID可以設(shè)計用于物種識別/交叉物種鑒定的基因芯片探針以及用于實時PCR的SYBR Green, TaqMan MGB, TaqMan探針, Molecular Beacons以及實時PCR引物。AlleleID還提供了支持可變剪切片段檢測的微陣列實驗設(shè)計。
    檢測成功的復(fù)雜算法
    高度特異性寡核苷酸通過回避自動注釋BLAST搜索結(jié)果找到的顯著同源性區(qū)域而設(shè)計。實時定量PCR引物和探針阻止模板形成二級結(jié)構(gòu)提升效率。"Minimal Set"，該程序最具創(chuàng)新性的特點(diǎn)之一，有助于設(shè)計最少數(shù)量的等位基因特異性寡核苷酸引物和雙標(biāo)記探針，其獨(dú)特地識別來自混合物的所需物種/菌株/類群中的每一個，降低化驗成本。對于類群或跨種分析，當(dāng)類群或類群高度不同時，該特征尤其有用。對于一組預(yù)先設(shè)計的、經(jīng)過驗證的引物集合，AlleleID可以設(shè)計兼容的引物和探針的其余序列的物種鑒定或類群特異性檢測。


    廣泛支持實時或定量PCR檢測和SNP/表達(dá)微陣列
    AlleleID可以設(shè)計最優(yōu)的SYBR Green引物、TaqMan探針、TaqMan Minor Groove Bingding
    (MGB)探針、FRET探針或者分子信標(biāo)，用于實時定量PCR差異基因表達(dá)SNP基因型分類試驗。您也可以設(shè)計實時PCR引物和雙標(biāo)記探針多達(dá)一萬個序列在一個單一的運(yùn)行SNP檢測或表達(dá)微陣列。
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    北京天演融智軟件有限公司（亦稱：融智軟件）前身是北京世紀(jì)天演科技有限公司，成立于2001年，專注為國內(nèi)高校、科研院所和以研發(fā)為主的企事業(yè)單位提供優(yōu)秀科研軟件和服務(wù)的。 科學(xué)軟件網(wǎng)是一個以引進(jìn)國外優(yōu)秀科研軟件，提供軟件服務(wù)的營業(yè)網(wǎng)站，網(wǎng)站由北京天演融智軟件有限公司創(chuàng)辦，旨在為國內(nèi)高校、科研院所和以研發(fā)為主的企業(yè)事業(yè)單位提供優(yōu)秀的科研軟件及相關(guān)軟件服務(wù)。截止目前，科學(xué)軟件網(wǎng)已獲得數(shù)百家世界軟件公司正式授權(quán)，代理銷售科研軟件達(dá)一千余種，軟件涵蓋領(lǐng)域包括經(jīng)管，電力系統(tǒng)模擬，地球地理，生物化學(xué)，工程科學(xué)，排版及網(wǎng)絡(luò)管理等。同時，還提供專業(yè)培訓(xùn)、視頻課程（包含34款軟件，64門課程）、實驗室解決方案和項目咨詢等服務(wù)。    不管您是需要購買單款軟件，還是制定整個實驗室的購買方案，都可以提供。   重點(diǎn)經(jīng)管類軟件SPSS
Statistics  統(tǒng)計分析軟件Stata 數(shù)管理統(tǒng)計繪圖軟件Minitab 統(tǒng)計分析軟件Matlab 技術(shù)計算語言GAMS 數(shù)學(xué)編程和優(yōu)化的建模系統(tǒng)Mathematica 科學(xué)計算軟件Tableau 數(shù)據(jù)可視化軟件SAS 數(shù)據(jù)分析軟件LinGo 運(yùn)籌優(yōu)化軟件Mplus 結(jié)構(gòu)方程模型@risk 風(fēng)險與決策分析軟件包Risk
Simulator  風(fēng)險評估軟件EViews 經(jīng)濟(jì)計量預(yù)測分析軟件NVivo/Atlas.ti/MaxQDA 定性分析軟件CGE
Visual 政策模擬與評價可視化系統(tǒng)OxMetrics 經(jīng)濟(jì)計量軟件Vensim/Ithink/Stella 系統(tǒng)動力學(xué)軟件Crystal
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