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    分子繪制的可能性
    Chemcraft生成高質(zhì)量的32位分子圖像。它被設(shè)計成一個用于創(chuàng)建發(fā)布就緒圖像的程序，不需要任何額外的修改。圖片可以很容易地在原子/鍵和附加對象，如標(biāo)簽和線條。Chemcraft包含一個標(biāo)準(zhǔn)顯示方案的集合。每個方案代表一組定義分子外觀的參數(shù)：照明參數(shù)、單個原子和鍵的顏色和大小等。圖10說明了四種集合方案。Chemcraft允許用戶更改單個方案的參數(shù)，或者將自己的方案添加到集合中。Chemcraft的圖形引擎不需要任何圖形加速或額外的圖形庫。被很好的優(yōu)化并提供，并提供高渲染速度，即使在過時的電腦。
    chemcraft怎樣用
    Chemcraft支持一個接口，用于快速創(chuàng)建具有非標(biāo)準(zhǔn)基組的GAMES-US輸入文件的部分（圖4）。從它們的描述中提取基集，可以在PNNL的網(wǎng)頁上獲得。她們還可以由用戶指定gaussians來補(bǔ)充。


    Chemcraft對于Gaussian用戶
    我們建議在Gaussian輸入文件中輸入#P GFINPUT POP(FULL, NBO)，以通過Chemcraft實現(xiàn)Gaussian輸入文件的可視化。#P選項支持?jǐn)U展打印輸出；GFINPUT選項允許打印基組信息（基組中的基元的描述），而POP(FULL)可打印所有分子軌道系數(shù)(POP(REGULAR)也可以使用)。后兩個關(guān)鍵詞允許Chemcraft可視化分子軌道。POP（NBO）實現(xiàn)了自然鍵軌道分析的打印輸出，其中計算了分子中的鍵。所有這些關(guān)鍵詞都是可取的，但不是必需的。至于GAMES文件，可以從文件中看到不同的數(shù)據(jù)：原子核上的能量（能量梯度）、原子電荷、自旋密度和其他原子屬性、NBO鍵屬性（使用量、能量）、正常模式、分子軌道（Cartesian（6d等）或internal（5d）函數(shù)都可以被可視化），MO能量。從文件中讀取標(biāo)準(zhǔn)或輸入/ Z矩陣方向上的坐標(biāo)并顯示在圖像上（這是為了正確地可視原子核上的能量所必需的，因為它們通常以不同于其他屬性的排列方向打印）。對于能量表面掃描和IRC作業(yè)，所有幾何形狀按掃描步驟分組。對于每一個幾何或振動模式，最基本的數(shù)據(jù)概述并以“摘要”的形式顯示（SCF能量，收斂標(biāo)準(zhǔn)等）。Chemcraft讀取多步驟Gaussian作業(yè)，然后呈現(xiàn)為幾個擴(kuò)展節(jié)點的列表，每個節(jié)點表示文件中的單個作業(yè)。除了Gaussian輸出文件外，Chemcraft還可以讀取Formatted Checkpoint文件（.fch）, 從文件中提取分子結(jié)構(gòu)和軌道。對于分子軌道和其他性質(zhì)的可視化，Gaussian立方體文件也可以讀取。
    ? 不同的原子屬性可以以標(biāo)簽的形式顯示：Mulliken種群和電荷、自旋密度、價態(tài)；
    ? 鍵序（以標(biāo)簽的形式顯示在結(jié)合物上）；
    ? 分子軌道可視為等值面或彩色平面；
    ? 振動模式可以動畫或以指針的形式（位移矢量）顯示；
    ? 偶極矩可視為指針；
    ? MO能量可以以數(shù)字形式顯示。
    chemcraft怎樣用
    Chemcraft包含一組便于量子化計算的圖形工具。它提供了方便的實用程序，有助于準(zhǔn)備新的工作來計算和分析計算結(jié)果。其主要功能是對量子化學(xué)包生成的輸出文件的可視化。主要支持的軟件包是Gamess（美國版本和PCGamess）和Gaussian94-09。
    Chemcraft對于Gamess用戶
    Chemcraft給Gamess-US輸出文件提供了非常詳細(xì)的可視化。文件中的下列數(shù)據(jù)可以以圖形方式呈現(xiàn)：
    原子坐標(biāo)（對應(yīng)于所有或?qū)ΨQ唯一的原子，如果在文件中呈現(xiàn)對應(yīng)的表）；
    如果文件中給出了鍵階分析，文件中的結(jié)合物顯示在圖像上（否則通過距離算法計算結(jié)合物）；
    能量梯度可以以指針的形式顯示（圖2）；
    不同的原子屬性可以以標(biāo)簽的形式顯示：Mulliken種群和電荷、自旋密度、價態(tài)；
    鍵序（以標(biāo)簽的形式顯示在結(jié)合物上）；
    分子軌道可視為等值面或彩色平面；
    振動模式可以動畫或以指針的形式（位移矢量）顯示；
    偶極矩可視為指針；
    MO能量可以以數(shù)字形式顯示。
    chemcraft怎樣用
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