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    評(píng)估預(yù)設(shè)計(jì)的引物和探針
    PrimerPlex可以使用預(yù)先設(shè)計(jì)的經(jīng)過驗(yàn)證的oligos來構(gòu)建復(fù)用集。在為每個(gè)序列指定了oligo之后，對(duì)它們的屬性進(jìn)行分析，并為發(fā)現(xiàn)的任何偏差提醒用戶。對(duì)于預(yù)先設(shè)計(jì)的oligos不可用的序列，PrimerPlex設(shè)計(jì)它們，檢查它們是否復(fù)用，并強(qiáng)調(diào)兼容性問題。然后用戶可以決定接受這個(gè)設(shè)計(jì)或者創(chuàng)建一個(gè)單獨(dú)的池。這個(gè)功能在用戶的手中提供了完全的控制。
    對(duì)于SNP的基因型研究，PrimerPlex設(shè)計(jì)了SNP的旁側(cè)引物。其結(jié)果包括每個(gè)DNA模板的引物對(duì)，包括產(chǎn)品尺寸、退火溫度等物理化學(xué)寡聚物性能。此外，二級(jí)結(jié)構(gòu)的圖形顯示也可用以幫助確定它們是否會(huì)阻礙反應(yīng)。
    PrimerPlex 多重PCR和高通量SNP基因分型和分析的Oligo設(shè)計(jì)

    下一代測(cè)序分析
    使用PrimePlex設(shè)計(jì)多重oligos，用于預(yù)先測(cè)序的樣品制備和突變檢測(cè)，如SNPs，DIPs（刪除/插入多態(tài)性）和MNPs（多核苷酸多態(tài)性），就像點(diǎn)擊幾個(gè)按鈕一樣簡單。
    引物特異性
    程序BLAST搜索在單個(gè)搜索運(yùn)行中搜索多個(gè)序列。結(jié)果會(huì)自動(dòng)解釋，并在引物設(shè)計(jì)中避免識(shí)別出現(xiàn)的同源性，從而確保設(shè)計(jì)是高度特異的。

    評(píng)估預(yù)設(shè)計(jì)的引物和探針
    PrimerPlex可以使用預(yù)先設(shè)計(jì)的經(jīng)過驗(yàn)證的oligos來構(gòu)建復(fù)用集。在為每個(gè)序列指定了oligo之后，對(duì)它們的屬性進(jìn)行分析，并為發(fā)現(xiàn)的任何偏差提醒用戶。對(duì)于預(yù)先設(shè)計(jì)的oligos不可用的序列，PrimerPlex設(shè)計(jì)它們，檢查它們是否復(fù)用，并強(qiáng)調(diào)兼容性問題。然后用戶可以決定接受這個(gè)設(shè)計(jì)或者創(chuàng)建一個(gè)單獨(dú)的池。這個(gè)功能在用戶的手中提供了完全的控制。

    添加MagPlex TAGs
    該程序現(xiàn)在還支持一個(gè)MagPlex TAGs的數(shù)據(jù)庫，以及MicroPlex xTAGs（以前稱為FlexMAP TAGs），用于自動(dòng)向每個(gè)ASPE引物添加適當(dāng)?shù)臉?biāo)簽。標(biāo)簽是這樣選擇的，它們使二聚化最小化，并且不折疊在它們所附著的oligo上。此外，用戶可以覆蓋程序的建議，并自己選擇標(biāo)簽。如果標(biāo)簽不是唯一的，或者選擇的標(biāo)簽與oligo不兼容，PrimerPlex會(huì)向用戶發(fā)出警報(bào)。

    Multiplex PCR Primer Design Software
    PrimerPlex is an efficient & sophisticated tool for designing primers for multiplex PCR. Multiplex assays facilitate amplification of multiple targets in a single reaction vessel, reducing both, the time and cost of experimentation.

    Oligo Design for Multiplex PCR & High Throughput SNP Genotyping and Analysis
    PrimerPlex is an efficient and sophisticated tool for designing oligos for multiplex assays. Multiplex assays facilitate amplification of multiple targets in a single reaction vessel, reducing both the time and cost of experimentation.

    對(duì)于SNP的基因型研究，PrimerPlex設(shè)計(jì)了SNP的旁側(cè)引物。其結(jié)果包括每個(gè)DNA模板的引物對(duì)，包括產(chǎn)品尺寸、退火溫度等物理化學(xué)寡聚物性能。此外，二級(jí)結(jié)構(gòu)的圖形顯示也可用以幫助確定它們是否會(huì)阻礙反應(yīng)。


    多重PCR檢測(cè)用于基因表達(dá)分析（使用凝膠電泳的終點(diǎn)檢測(cè)），用于高通量SNP應(yīng)用，如基因分型，用于下一代測(cè)序所需的目標(biāo)濃縮、病原體檢測(cè)、菌株分型和單倍型分型。PrimerPlex還設(shè)計(jì)了最優(yōu)等位基因特異性捕捉探針和Allele Specific Primer Extension (ASPE)引物用于高通量SNP基因型分析。
    功能
    多重SNP檢測(cè)和高通量基因型
    使用PrimerPlex，您可以設(shè)計(jì)SNP在旁側(cè)的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕獲探針。PrimerPlex使您能夠通過它們中每一個(gè)設(shè)計(jì)oligo，來檢測(cè)一個(gè)中等大小的基因組序列的所有突變。檢查這些引物和探針以進(jìn)行復(fù)用，并顯示最佳可能的集合。


    多重PCR引物設(shè)計(jì)
    設(shè)計(jì)用于多重分析的引物集可能是一項(xiàng)具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)。PrimerPlex使用創(chuàng)新的和專有的算法來設(shè)計(jì)最優(yōu)的多重引物集，最大限度地減少Tm失配所有的集合進(jìn)行交叉反應(yīng)分析，以確保特定和有效的擴(kuò)增。您可以從一系列交替呈現(xiàn)的各種排序順序中選擇最適合您的實(shí)驗(yàn)需求的集合。使用PrimerPlex，您可以靈活地設(shè)計(jì)引物，無論是朝向3'端，還是5'端，在這些端點(diǎn)的指定距離或序列內(nèi)的任何地方。


    對(duì)于SNP的基因型分析，該程序設(shè)計(jì)了引物旁側(cè)突變，如SNPs、DIPs（刪除/插入多態(tài)性）和MNPs（多核苷酸多態(tài)性）。
    primerplex軟件中文教程
    多重PCR檢測(cè)用于基因表達(dá)分析（使用凝膠電泳的終點(diǎn)檢測(cè)），用于高通量SNP應(yīng)用，如基因分型，用于下一代測(cè)序所需的目標(biāo)濃縮、病原體檢測(cè)、菌株分型和單倍型分型。PrimerPlex還設(shè)計(jì)了最優(yōu)等位基因特異性捕捉探針和Allele Specific Primer Extension (ASPE)引物用于高通量SNP基因型分析。
    全面的分析支持
    使用PrimerPlex為多重PCR、ASPE和直接雜交分析設(shè)計(jì)oligos。oligos被篩選為交叉反應(yīng)性，以確保高信號(hào)強(qiáng)度，最大限度地減少Tm失配。oligos篩選二聚體、運(yùn)行和重復(fù)。



    多重PCR檢測(cè)用于基因表達(dá)分析（使用凝膠電泳的終點(diǎn)檢測(cè)），用于高通量SNP應(yīng)用，如基因分型，用于下一代測(cè)序所需的目標(biāo)濃縮、病原體檢測(cè)、菌株分型和單倍型分型。PrimerPlex還設(shè)計(jì)了最優(yōu)等位基因特異性捕捉探針和Allele Specific Primer Extension (ASPE)引物用于高通量SNP基因型分析。
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