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    與其他格式一起工作
    除了Gamess-US, Gaussian 和ADF文件，Chemcraft可以讀取NWChem、Jaguar、Oraca、Dalton、GAMESE-UK、Turbomole、MMOPRO和QChem輸出文件、HyperChem文件、MSI或PDB格式的文件（這些格式未被全面支持）和MolDraw and Priroda程序格式、NBO格式（.31-.40文件）、Molden文件、MFJ、SDF和Tinker、Crystal文件、VASP和Shellx文件、晶體學(xué)CIF文件和簡(jiǎn)單的文本文件與原子的Cartesian坐標(biāo)。Chemcraft提供了一個(gè)通過剪貼板導(dǎo)入/導(dǎo)出文本格式的原子坐標(biāo)的接口，這有助于使用任何類型的計(jì)算數(shù)據(jù)。將原子坐標(biāo)導(dǎo)出到剪貼板中對(duì)于快速創(chuàng)建輸入文件也是有用的。Chemcraft包含一個(gè)分?jǐn)?shù)坐標(biāo)轉(zhuǎn)換的功能，用于晶體學(xué)測(cè)量和Cartesian，反之亦然，用于單元參數(shù)（a,b,c等）。
    Chemcraft包含一組便于量子化計(jì)算的圖形工具。

    分子軌道可視化的例子
    Chemcraft支持一個(gè)接口，用于快速創(chuàng)建具有非標(biāo)準(zhǔn)基組的GAMES-US輸入文件的部分（圖4）。從它們的描述中提取基集，可以在PNNL的網(wǎng)頁(yè)上獲得
    /forms/basisform.html)。她們還可以由用戶指定gaussians來(lái)補(bǔ)充。

    Chemcraft對(duì)于Gaussian用戶
    我們建議在Gaussian輸入文件中輸入#P GFINPUT POP(FULL, NBO)，以通過Chemcraft實(shí)現(xiàn)Gaussian輸入文件的可視化。#P選項(xiàng)支持?jǐn)U展打印輸出；GFINPUT選項(xiàng)允許打印基組信息（基組中的基元的描述），而POP(FULL)可打印所有分子軌道系數(shù)(POP(REGULAR)也可以使用)。后兩個(gè)關(guān)鍵詞允許Chemcraft可視化分子軌道。POP（NBO）實(shí)現(xiàn)了自然鍵軌道分析的打印輸出，其中計(jì)算了分子中的鍵。所有這些關(guān)鍵詞都是可取的，但不是必需的。至于GAMES文件，可以從文件中看到不同的數(shù)據(jù)：原子核上的能量（能量梯度）、原子電荷、自旋密度和其他原子屬性、NBO鍵屬性（使用量、能量）、正常模式、分子軌道（Cartesian（6d等）或internal（5d）函數(shù)都可以被可視化），MO能量。從文件中讀取標(biāo)準(zhǔn)或輸入/ Z矩陣方向上的坐標(biāo)并顯示在圖像上（這是為了正確地可視原子核上的能量所必需的，因?yàn)樗鼈兺ǔＲ圆煌谄渌麑傩缘呐帕蟹较虼蛴。?。?duì)于能量表面掃描和IRC作業(yè)，所有幾何形狀按掃描步驟分組。對(duì)于每一個(gè)幾何或振動(dòng)模式，最基本的數(shù)據(jù)概述并以“摘要”的形式顯示（SCF能量，收斂標(biāo)準(zhǔn)等）。Chemcraft讀取多步驟Gaussian作業(yè)，然后呈現(xiàn)為幾個(gè)擴(kuò)展節(jié)點(diǎn)的列表，每個(gè)節(jié)點(diǎn)表示文件中的單個(gè)作業(yè)。除了Gaussian輸出文件外，Chemcraft還可以讀取Formatted Checkpoint文件（.fch）, 從文件中提取分子結(jié)構(gòu)和軌道。對(duì)于分子軌道和其他性質(zhì)的可視化，Gaussian立方體文件也可以讀取。


    1.Interface of Chemcraft.
    Chemcraft for Gamess users
    Chemcraft provides very detailed visualization of Gamess-US output files. The following data from the files can be presented graphically:

    - Atomic coordinates (corresponding to either all or symmetry unique atoms, if corresponding tables are presented in the file);

    - If bond order analysis is presented in the file, bonds from the file are shown on the image (otherwise, bonds are calculated by distance algorithm);

    - Energy gradient can be shown in the form of pointers (fig. 2);

    - Different atomic properties can be shown as labels on atoms: Mulliken populations and charges, spin densities, valences;



    Chemcraft包含一組便于量子化計(jì)算的圖形工具。它提供了方便的實(shí)用程序，有助于準(zhǔn)備新的工作來(lái)計(jì)算和分析計(jì)算結(jié)果。其主要功能是對(duì)量子化學(xué)包生成的輸出文件的可視化。主要支持的軟件包是Gamess（美國(guó)版本和PCGamess）和Gaussian94-09。
    chemcraft軟件價(jià)格
    Chemcraft包含一組便于量子化計(jì)算的圖形工具。它提供了方便的實(shí)用程序，有助于準(zhǔn)備新的工作來(lái)計(jì)算和分析計(jì)算結(jié)果。其主要功能是對(duì)量子化學(xué)包生成的輸出文件的可視化。主要支持的軟件包是Gamess（美國(guó)版本和PCGamess）和Gaussian94-09。
    Chemcraft對(duì)于Gamess用戶
    Chemcraft給Gamess-US輸出文件提供了非常詳細(xì)的可視化。文件中的下列數(shù)據(jù)可以以圖形方式呈現(xiàn)：
    原子坐標(biāo)（對(duì)應(yīng)于所有或?qū)ΨQ唯一的原子，如果在文件中呈現(xiàn)對(duì)應(yīng)的表）；
    如果文件中給出了鍵階分析，文件中的結(jié)合物顯示在圖像上（否則通過距離算法計(jì)算結(jié)合物）；
    能量梯度可以以指針的形式顯示（圖2）；
    不同的原子屬性可以以標(biāo)簽的形式顯示：Mulliken種群和電荷、自旋密度、價(jià)態(tài)；
    鍵序（以標(biāo)簽的形式顯示在結(jié)合物上）；
    分子軌道可視為等值面或彩色平面；
    振動(dòng)模式可以動(dòng)畫或以指針的形式（位移矢量）顯示；
    偶極矩可視為指針；
    MO能量可以以數(shù)字形式顯示。
    chemcraft軟件價(jià)格
    能量梯度可視化實(shí)例

    Chemcraft從Gamess-US輸出文件中提取分子軌道系數(shù)和基組信息，以等密度面的形式呈現(xiàn)分子軌道或由密度值著色的表面（平面、球體）（參加圖3）。Chemcraft提供用軌道執(zhí)行操作的一些可能性（例如將一個(gè)軌道乘以另一個(gè)軌道）。創(chuàng)建軌道的公式取自GAMESS-US分發(fā)的PLTROB程序的源代碼。用密度值計(jì)算立方體能被很好地優(yōu)化。注意，如果文件中有多個(gè)分子軌道系數(shù)表，Chemcraft可以提取它們中的每一個(gè)并允許它們被渲染（例如，在MCSCF計(jì)算中，可以顯示規(guī)范或自然軌道）。除了軌道的可視化，Chemcraft還提供了一個(gè)簡(jiǎn)單實(shí)用的工具，用于自動(dòng)確定原子軌道形成每個(gè)分子軌道，這對(duì)分析軌道很有用。

    Chemcraft basics
    Chemcraft comprises a set of graphical tools for facilitating working with quantum chemistry computations. It provides convenient utilities, which help to prepare new jobs for calculation and analyze computed results. Among the main functions of the program is visualization of output files produced by quantum-chemical packages. The main supported packages are Gamess (US version and the PCGamess) and Gaussian94-09.
    Chencraft支持一組用于構(gòu)造分子結(jié)構(gòu)的工具，這些工具可用于準(zhǔn)備計(jì)算或其他目的的初始猜測(cè)：
    ? 從標(biāo)準(zhǔn)分子片段（自由基等）中構(gòu)建分子，提供了通過自定義剪貼板來(lái)補(bǔ)充該片段集并通過剪貼板復(fù)制/粘貼單個(gè)片段的可能性；
    ? 修改分子中的任何幾何參數(shù)（距離、角度、二面角）。該修飾可以伴隨著一個(gè)原子、兩個(gè)原子或選定的原子群的位移；
    ? 用鼠標(biāo)在分子圖像上拖曳原子或碎片或旋轉(zhuǎn)碎片的可能性（圖5）；
    ? 應(yīng)用任意幾何參數(shù)集合的迭代算法（圖6）；
    ? 一種易于使用的實(shí)用程序，用于將點(diǎn)群應(yīng)用于分子（圖8）。

    5. “拖曳”原子或沿鍵旋轉(zhuǎn)碎片的例子
    當(dāng)“拖動(dòng)”原子或執(zhí)行其他結(jié)構(gòu)修改時(shí)，任何幾何參數(shù)都可以控制在圖像上（見圖5）。Chemcraft的界面允許人們輕松地改變?nèi)魏卧拥念愋突虿迦?移除一個(gè)鍵。Chemcraft提供了快速獲取Z矩陣的實(shí)用工具。Z矩陣是通過點(diǎn)擊分子中的原子并指定一些附加信息來(lái)建立的（圖7）。在使用這個(gè)工具之前，首先應(yīng)該在Cartesian坐標(biāo)中獲得分子的結(jié)構(gòu)。所有用于構(gòu)建分子的上述工具都可用于此目的。
    Chemcraft對(duì)于Gamess用戶
    Chemcraft給Gamess-US輸出文件提供了非常詳細(xì)的可視化。文件中的下列數(shù)據(jù)可以以圖形方式呈現(xiàn)：
    ? 原子坐標(biāo)（對(duì)應(yīng)于所有或?qū)ΨQ唯一的原子，如果在文件中呈現(xiàn)對(duì)應(yīng)的表）；
    ? 如果文件中給出了鍵階分析，文件中的結(jié)合物顯示在圖像上（否則通過距離算法計(jì)算結(jié)合物）；
    ? 能量梯度可以以指針的形式顯示（圖2）；
    chemcraft軟件價(jià)格
    -/gjjiac/-

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