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    PrimerPlex 多重PCR和高通量SNP基因分型和分析的Oligo設(shè)計(jì)

    功能
    多重SNP檢測(cè)和高通量基因型
    使用PrimerPlex，您可以設(shè)計(jì)SNP在旁側(cè)的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕獲探針。PrimerPlex使您能夠通過它們中每一個(gè)設(shè)計(jì)oligo，來(lái)檢測(cè)一個(gè)中等大小的基因組序列的所有突變。檢查這些引物和探針以進(jìn)行復(fù)用，并顯示最佳可能的集合。

    多重PCR引物設(shè)計(jì)
    設(shè)計(jì)用于多重分析的引物集可能是一項(xiàng)具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)。PrimerPlex使用創(chuàng)新的和專有的算法來(lái)設(shè)計(jì)最優(yōu)的多重引物集，最大限度地減少Tm失配所有的集合進(jìn)行交叉反應(yīng)分析，以確保特定和有效的擴(kuò)增。您可以從一系列交替呈現(xiàn)的各種排序順序中選擇最適合您的實(shí)驗(yàn)需求的集合。使用PrimerPlex，您可以靈活地設(shè)計(jì)引物，無(wú)論是朝向3'端，還是5'端，在這些端點(diǎn)的指定距離或序列內(nèi)的任何地方。

    對(duì)于SNP的基因型分析，該程序設(shè)計(jì)了引物旁側(cè)突變，如SNPs、DIPs（刪除/插入多態(tài)性）和MNPs（多核苷酸多態(tài)性）。

    全面的分析支持
    使用PrimerPlex為多重PCR、ASPE和直接雜交分析設(shè)計(jì)oligos。oligos被篩選為交叉反應(yīng)性，以確保高信號(hào)強(qiáng)度，最大限度地減少Tm失配。oligos篩選二聚體、運(yùn)行和重復(fù)。

    Features
    Multiplex SNP Detection and High Throughput Genotyping
    With PrimerPlex, you can design multiplex PCR primers flanking the SNP, ASPE primers with SNPs at the 3' end and capture probes with SNPs at their center. PrimerPlex enables you to detect all the mutations of a medium sized genomic sequence by designing oligos for each one of them. These primers and probes are checked for multiplexing and the best possible set is displayed.

    Multiplex PCR Primer Design
    Designing primer sets that work well for a multiplex assay can be a challenging task. PrimerPlex uses innovative and proprietary algorithms to design optimal multiplex primer sets, minimizing Tm mismatches. All sets are analyzed for cross reactivity to ensure specific and efficient
    PrimerPlex是一種高效、復(fù)雜的工具，用于設(shè)計(jì)oligo并進(jìn)行多重分析。多重分析促進(jìn)了單個(gè)反應(yīng)容器中多個(gè)目標(biāo)的擴(kuò)增，減少了實(shí)驗(yàn)的時(shí)間和成本。



    多重PCR檢測(cè)用于基因表達(dá)分析（使用凝膠電泳的終點(diǎn)檢測(cè)），用于高通量SNP應(yīng)用，如基因分型，用于下一代測(cè)序所需的目標(biāo)濃縮、病原體檢測(cè)、菌株分型和單倍型分型。PrimerPlex還設(shè)計(jì)了最優(yōu)等位基因特異性捕捉探針和Allele Specific Primer Extension (ASPE)引物用于高通量SNP基因型分析。


    功能
    多重SNP檢測(cè)和高通量基因型
    使用PrimerPlex，您可以設(shè)計(jì)SNP在旁側(cè)的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕獲探針。PrimerPlex使您能夠通過它們中每一個(gè)設(shè)計(jì)oligo，來(lái)檢測(cè)一個(gè)中等大小的基因組序列的所有突變。檢查這些引物和探針以進(jìn)行復(fù)用，并顯示最佳可能的集合。
    primerplex百度百科
    對(duì)于SNP的基因型研究，PrimerPlex設(shè)計(jì)了SNP的旁側(cè)引物。其結(jié)果包括每個(gè)DNA模板的引物對(duì)，包括產(chǎn)品尺寸、退火溫度等物理化學(xué)寡聚物性能。此外，二級(jí)結(jié)構(gòu)的圖形顯示也可用以幫助確定它們是否會(huì)阻礙反應(yīng)。
    primerplex百度百科
    全面的分析支持
    使用PrimerPlex為多重PCR、ASPE和直接雜交分析設(shè)計(jì)oligos。oligos被篩選為交叉反應(yīng)性，以確保高信號(hào)強(qiáng)度，最大限度地減少Tm失配。oligos篩選二聚體、運(yùn)行和重復(fù)。
    PrimerPlex 多重PCR和高通量SNP基因分型和分析的Oligo設(shè)計(jì)

    下一代測(cè)序分析
    使用PrimePlex設(shè)計(jì)多重oligos，用于預(yù)先測(cè)序的樣品制備和突變檢測(cè)，如SNPs，DIPs（刪除/插入多態(tài)性）和MNPs（多核苷酸多態(tài)性），就像點(diǎn)擊幾個(gè)按鈕一樣簡(jiǎn)單。
    引物特異性
    程序BLAST搜索在單個(gè)搜索運(yùn)行中搜索多個(gè)序列。結(jié)果會(huì)自動(dòng)解釋，并在引物設(shè)計(jì)中避免識(shí)別出現(xiàn)的同源性，從而確保設(shè)計(jì)是高度特異的。

    評(píng)估預(yù)設(shè)計(jì)的引物和探針
    PrimerPlex可以使用預(yù)先設(shè)計(jì)的經(jīng)過驗(yàn)證的oligos來(lái)構(gòu)建復(fù)用集。在為每個(gè)序列指定了oligo之后，對(duì)它們的屬性進(jìn)行分析，并為發(fā)現(xiàn)的任何偏差提醒用戶。對(duì)于預(yù)先設(shè)計(jì)的oligos不可用的序列，PrimerPlex設(shè)計(jì)它們，檢查它們是否復(fù)用，并強(qiáng)調(diào)兼容性問題。然后用戶可以決定接受這個(gè)設(shè)計(jì)或者創(chuàng)建一個(gè)單獨(dú)的池。這個(gè)功能在用戶的手中提供了完全的控制。

    添加MagPlex TAGs
    該程序現(xiàn)在還支持一個(gè)MagPlex TAGs的數(shù)據(jù)庫(kù)，以及MicroPlex xTAGs（以前稱為FlexMAP TAGs），用于自動(dòng)向每個(gè)ASPE引物添加適當(dāng)?shù)臉?biāo)簽。標(biāo)簽是這樣選擇的，它們使二聚化最小化，并且不折疊在它們所附著的oligo上。此外，用戶可以覆蓋程序的建議，并自己選擇標(biāo)簽。如果標(biāo)簽不是唯一的，或者選擇的標(biāo)簽與oligo不兼容，PrimerPlex會(huì)向用戶發(fā)出警報(bào)。


    Next Generation Sequencing Assay
    With PrimePlex, designing multiplex oligos for pre-sequencing sample preparation and mutation detection such as SNPs, DIPs (Deletion/Insertion Polymorphisms) and MNPs (Multiple Nucleotide Polymorphisms) is as easy as clicking a few buttons.

    Primer Specificity
    The program BLAST searches multiple sequences in a single search run. The results are automatically interpreted and the homologies identified are avoided during primer design, ensuring that the design is highly specific.
    下一代測(cè)序分析
    使用PrimePlex設(shè)計(jì)多重oligos，用于預(yù)先測(cè)序的樣品制備和突變檢測(cè)，如SNPs，DIPs（刪除/插入多態(tài)性）和MNPs（多核苷酸多態(tài)性），就像點(diǎn)擊幾個(gè)按鈕一樣簡(jiǎn)單。


    引物特異性
    程序BLAST搜索在單個(gè)搜索運(yùn)行中搜索多個(gè)序列。結(jié)果會(huì)自動(dòng)解釋，并在引物設(shè)計(jì)中避免識(shí)別出現(xiàn)的同源性，從而確保設(shè)計(jì)是高度特異的。

    primerplex百度百科
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