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    對于SNP的基因型研究，PrimerPlex設(shè)計了SNP的旁側(cè)引物。其結(jié)果包括每個DNA模板的引物對，包括產(chǎn)品尺寸、退火溫度等物理化學(xué)寡聚物性能。此外，二級結(jié)構(gòu)的圖形顯示也可用以幫助確定它們是否會阻礙反應(yīng)。

    PrimerPlex是一種高效、復(fù)雜的工具，用于設(shè)計oligo并進(jìn)行多重分析。多重分析促進(jìn)了單個反應(yīng)容器中多個目標(biāo)的擴(kuò)增，減少了實驗的時間和成本。


    PRIMERPLEX
    多重PCR檢測用于基因表達(dá)分析（使用凝膠電泳的終點檢測），用于高通量SNP應(yīng)用，如基因分型，用于下一代測序所需的目標(biāo)濃縮、病原體檢測、菌株分型和單倍型分型。PrimerPlex還設(shè)計了最優(yōu)等位基因特異性捕捉探針和Allele Specific Primer Extension (ASPE)引物用于高通量SNP基因型分析。

    功能
    多重SNP檢測和高通量基因型
    使用PrimerPlex，您可以設(shè)計SNP在旁側(cè)的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕獲探針。PrimerPlex使您能夠通過它們中每一個設(shè)計oligo，來檢測一個中等大小的基因組序列的所有突變。檢查這些引物和探針以進(jìn)行復(fù)用，并顯示最佳可能的集合。

    多重PCR引物設(shè)計
    設(shè)計用于多重分析的引物集可能是一項具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)。PrimerPlex使用創(chuàng)新的和專有的算法來設(shè)計最優(yōu)的多重引物集，最大限度地減少Tm失配所有的集合進(jìn)行交叉反應(yīng)分析，以確保特定和有效的擴(kuò)增。您可以從一系列交替呈現(xiàn)的各種排序順序中選擇最適合您的實驗需求的集合。使用PrimerPlex，您可以靈活地設(shè)計引物，無論是朝向3'端，還是5'端，在這些端點的指定距離或序列內(nèi)的任何地方。

    多重PCR引物設(shè)計
    設(shè)計用于多重分析的引物集可能是一項具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)。PrimerPlex使用創(chuàng)新的和專有的算法來設(shè)計最優(yōu)的多重引物集，最大限度地減少Tm失配所有的集合進(jìn)行交叉反應(yīng)分析，以確保特定和有效的擴(kuò)增。您可以從一系列交替呈現(xiàn)的各種排序順序中選擇最適合您的實驗需求的集合。使用PrimerPlex，您可以靈活地設(shè)計引物，無論是朝向3'端，還是5'端，在這些端點的指定距離或序列內(nèi)的任何地方。


    多重PCR引物設(shè)計提出了幾個挑戰(zhàn)，其中包括引物二聚體、不能分離具有類似的電泳遷移率的擴(kuò)增子以及由于非特異性結(jié)合非靶標(biāo)DNA模板導(dǎo)致的引導(dǎo)錯誤。PrimerPlex使用專有算法，在超過100個序列的均勻反應(yīng)條件下設(shè)計最優(yōu)多重引物集。在池中篩選所有引物后，識別引物集合，并最大限度地減少Tm失配，以確保特定的放大和高信號強(qiáng)度。在這個過程中，它在幾秒鐘內(nèi)分析了數(shù)百萬個可能的多重引物集，并給出了一個備用集合的列表。您可以在設(shè)計的引物對中指定最小產(chǎn)品尺寸差異，以更好地可視化凝膠上的條帶。為了保證引物特異性，引物可以從PrimerPlex對NCBI中任何可用的基因組數(shù)據(jù)庫進(jìn)行BLAST搜索。
    PRIMERPLEX
    功能
    多重SNP檢測和高通量基因型
    使用PrimerPlex，您可以設(shè)計SNP在旁側(cè)的多重PCR引物、SNP在3’末端的ASPE引物以及SNPs在中心的捕獲探針。PrimerPlex使您能夠通過它們中每一個設(shè)計oligo，來檢測一個中等大小的基因組序列的所有突變。檢查這些引物和探針以進(jìn)行復(fù)用，并顯示最佳可能的集合。

    下一代測序分析
    使用PrimePlex設(shè)計多重oligos，用于預(yù)先測序的樣品制備和突變檢測，如SNPs，DIPs（刪除/插入多態(tài)性）和MNPs（多核苷酸多態(tài)性），就像點擊幾個按鈕一樣簡單。

    PRIMERPLEX
    多重PCR檢測用于基因表達(dá)分析（使用凝膠電泳的終點檢測），用于高通量SNP應(yīng)用，如基因分型，用于下一代測序所需的目標(biāo)濃縮、病原體檢測、菌株分型和單倍型分型。PrimerPlex還設(shè)計了最優(yōu)等位基因特異性捕捉探針和Allele Specific Primer Extension (ASPE)引物用于高通量SNP基因型分析。
    添加MagPlex TAGs
    該程序現(xiàn)在還支持一個MagPlex TAGs的數(shù)據(jù)庫，以及MicroPlex xTAGs（以前稱為FlexMAP TAGs），用于自動向每個ASPE引物添加適當(dāng)?shù)臉?biāo)簽。標(biāo)簽是這樣選擇的，它們使二聚化最小化，并且不折疊在它們所附著的oligo上。此外，用戶可以覆蓋程序的建議，并自己選擇標(biāo)簽。如果標(biāo)簽不是唯一的，或者選擇的標(biāo)簽與oligo不兼容，PrimerPlex會向用戶發(fā)出警報。

    對于SNP的基因型研究，PrimerPlex設(shè)計了SNP的旁側(cè)引物。其結(jié)果包括每個DNA模板的引物對，包括產(chǎn)品尺寸、退火溫度等物理化學(xué)寡聚物性能。此外，二級結(jié)構(gòu)的圖形顯示也可用以幫助確定它們是否會阻礙反應(yīng)。

    PRIMERPLEX
    對于SNP的基因型分析，該程序設(shè)計了引物旁側(cè)突變，如SNPs、DIPs（刪除/插入多態(tài)性）和MNPs（多核苷酸多態(tài)性）。

    全面的分析支持
    使用PrimerPlex為多重PCR、ASPE和直接雜交分析設(shè)計oligos。oligos被篩選為交叉反應(yīng)性，以確保高信號強(qiáng)度，最大限度地減少Tm失配。oligos篩選二聚體、運行和重復(fù)。

    引物特異性
    程序BLAST搜索在單個搜索運行中搜索多個序列。結(jié)果會自動解釋，并在引物設(shè)計中避免識別出現(xiàn)的同源性，從而確保設(shè)計是高度特異的。

    多重PCR檢測用于基因表達(dá)分析（使用凝膠電泳的終點檢測），用于高通量SNP應(yīng)用，如基因分型，用于下一代測序所需的目標(biāo)濃縮、病原體檢測、菌株分型和單倍型分型。PrimerPlex還設(shè)計了最優(yōu)等位基因特異性捕捉探針和Allele Specific Primer Extension (ASPE)引物用于高通量SNP基因型分析。
    全面的分析支持
    使用PrimerPlex為多重PCR、ASPE和直接雜交分析設(shè)計oligos。oligos被篩選為交叉反應(yīng)性，以確保高信號強(qiáng)度，最大限度地減少Tm失配。oligos篩選二聚體、運行和重復(fù)。


    PRIMERPLEX
    PrimerPlex是一種高效、復(fù)雜的工具，用于設(shè)計oligo并進(jìn)行多重分析。多重分析促進(jìn)了單個反應(yīng)容器中多個目標(biāo)的擴(kuò)增，減少了實驗的時間和成本。

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