食用菌利用農(nóng)作物秸稈為原料進(jìn)行栽培，生產(chǎn)過程中會產(chǎn)生雜菌污染廢棄物，生產(chǎn)結(jié)束后又剩下大量栽培廢料—菌渣。這些廢料如果不及時(shí)處理，會成為污染源，造成生產(chǎn)環(huán)境惡性循環(huán)，導(dǎo)致食用菌制種和栽培失敗機(jī)率增加。特別是規(guī)?；a(chǎn)，不可能采用焚燒和搬離場所等消極處理方法。要使食用菌生產(chǎn)走上生態(tài)高效經(jīng)濟(jì)循環(huán)發(fā)展道路，必須開發(fā)食用菌菌渣的綜合利用，在此基礎(chǔ)上形成食用菌—營養(yǎng)食品—大眾健康的產(chǎn)業(yè)鏈和農(nóng)作物秸稈—菌渣飼料—飼養(yǎng)業(yè)—有機(jī)肥料的農(nóng)業(yè)生態(tài)循環(huán)鏈，實(shí)現(xiàn)變害為利，變廢為寶，節(jié)本增益，促進(jìn)農(nóng)作物秸稈栽培食用菌產(chǎn)業(yè)良性循環(huán)和健康持續(xù)的發(fā)展。 
 (1) 菌渣生物飼料的開發(fā)利用 
 栽培食用菌的主要基質(zhì)棉籽殼、稻麥棉油秸稈、胡桑枝、玉米芯等，含有纖維素、半纖維素和木質(zhì)素等多糖，在栽培過程中被食用菌分泌的各種酶降解，菌渣中含有豐富的各種易吸收的有機(jī)物和礦物質(zhì)，再經(jīng)過生物發(fā)酵，粗蛋白、粗脂肪含量均比原來的基質(zhì)高二倍以上，可以做成飼料、餌料或其添加劑，用于豬、牛、羊、雞、鴨、兔、魚等動物飼料，替代部分糧食，降低飼養(yǎng)成本。 
 (2) 菌渣循環(huán)利用 
 利用自然界中無害微生物，對食用菌栽培中的污染物進(jìn)行堆制和漚制處理，使物料熟化，富集營養(yǎng)，成為用食用菌循環(huán)利用的優(yōu)質(zhì)基料。即食用菌種植后的菌渣廢料，可直接用作另一種食用菌栽培的部分原料，前茬菇的菌絲生長分泌各種酶，對基質(zhì)起熟化作用，為后茬菇提供速效營養(yǎng)物質(zhì)。 
 (3) 菌渣生產(chǎn)綠色肥料 
 食用菌栽培廢棄物加入無害化的添加劑，生產(chǎn)綠色有機(jī)肥料，用綠色肥料給農(nóng)作物、果林樹木施肥，可顯著增加土壤有機(jī)質(zhì)，改善土壤物理性狀，提高農(nóng)作物、果林樹木的產(chǎn)量和品質(zhì)，周而復(fù)始，轉(zhuǎn)化為循環(huán)經(jīng)濟(jì)。 
 (4) 菌渣基質(zhì)栽培 
 隨著設(shè)施栽培面積的不斷擴(kuò)大，由于大棚內(nèi)連年種植蔬菜，連作障礙（如病蟲害嚴(yán)重、土壤次生鹽漬化等）的問題越來越嚴(yán)重，傳統(tǒng)的無土栽培由于使用化學(xué)營養(yǎng)液或蛭石等基質(zhì)，存在著栽培成本高，操作難度大，不易推廣等缺點(diǎn)。利用豐富的菌渣作為無土栽培基質(zhì)生產(chǎn)蔬菜，既可顯著降低成本，簡化操作規(guī)程，又便于推廣，使蔬菜產(chǎn)量顯著提高，達(dá)到優(yōu)質(zhì)、安全、無公害。